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科研進(jìn)展

腫瘤防治中心徐瑞華教授團(tuán)隊(duì)牽頭構(gòu)建食道小細(xì)胞癌基因圖譜

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5月4日,我校腫瘤防治中心院長(zhǎng)徐瑞華課題組在著名期刊Cell Research 上在線(xiàn)發(fā)表了題為“食道小細(xì)胞癌基因圖譜”的文章(IF:15.6)。

文章首次報(bào)道了食道小細(xì)胞癌(SCCE)的基因組圖譜,揭示了食道小細(xì)胞癌中基因組水平的改變,為更好地理解食道小細(xì)胞癌的發(fā)病機(jī)制和尋找有效治療靶點(diǎn)和策略提供重要理論依據(jù)。

食道小細(xì)胞癌(SCCE)是最常見(jiàn)的肺外小細(xì)胞癌,占所有食道癌的1%-2.8%[1]。大多數(shù)食道小細(xì)胞癌患者在診斷后2年內(nèi)死亡,中位生存期僅為8-13個(gè)月。由于食道小細(xì)胞癌發(fā)病率極低,國(guó)際上缺乏基礎(chǔ)和前瞻性臨床研究,并且因其與小細(xì)胞肺癌的組織學(xué)和臨床的表現(xiàn)特征類(lèi)似,食道小細(xì)胞癌的治療一般采用已確立的小細(xì)胞肺癌治療策略。

化療最初對(duì)食道小細(xì)胞癌有效,但大多數(shù)患者會(huì)快速發(fā)生復(fù)發(fā)或進(jìn)展并在幾個(gè)月內(nèi)死亡[2]。迫切需要更有效和精確針對(duì)食道小細(xì)胞癌的治療策略,但缺乏關(guān)于這種致命性疾病的基因特點(diǎn)研究,很大層度上阻礙了對(duì)該疾病研究和治療的發(fā)展[3]。既往的基因組測(cè)序研究揭示了兩種常見(jiàn)食道惡性腫瘤,食道鱗癌和食道腺癌的潛在分子驅(qū)動(dòng)事件,并顯示它們具有獨(dú)特的分子特征,表明原發(fā)食道腫瘤的異質(zhì)性[4, 5]。

腫瘤防治中心徐瑞華教授團(tuán)隊(duì)自2012年起開(kāi)展了食道小細(xì)胞癌的系列研究,曾牽頭進(jìn)行了國(guó)際最大宗關(guān)于食道小細(xì)胞癌的回顧性研究,首次提出了對(duì)不同分期患者的治療原則 [6];進(jìn)一步通過(guò)臨床病理研究發(fā)現(xiàn)了干細(xì)胞標(biāo)記物L(fēng)gr5高表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、晚期、對(duì)化療反應(yīng)不佳和預(yù)后較差顯著相關(guān)[7]。

為了解這種致命性疾病的基因組特點(diǎn),并為開(kāi)發(fā)新的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),由我校腫瘤防治中心徐瑞華教授牽頭開(kāi)展了本研究。團(tuán)隊(duì)歷時(shí)五年,聯(lián)合了全國(guó)8家醫(yī)療或科研機(jī)構(gòu)(中山大學(xué)腫瘤防治中心、華大生命科學(xué)研究院、福建省腫瘤醫(yī)院、鄭州大學(xué)附屬第一醫(yī)院、安徽省立醫(yī)院、廣東醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院、廣東省人民醫(yī)院、揭陽(yáng)市人民醫(yī)院),通過(guò)高深度捕獲測(cè)序、拷貝數(shù)芯片、和全外顯子組對(duì)55例SCCE的腫瘤組織和癌旁正常組織進(jìn)行檢測(cè),結(jié)合一系列生物信息學(xué)分析和分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),在世界范圍內(nèi)首次揭示食道小細(xì)胞癌的基因組特征。

小細(xì)胞食管癌突變圖譜、拷貝數(shù)變異圖譜以及和其他腫瘤的比較

在本研究中,研究人員首次構(gòu)建了完整的食道小細(xì)胞癌基因組圖譜,發(fā)現(xiàn)了8個(gè)高頻突變基因,包括5個(gè)在癌癥中研究的比較廣泛的基因TP53、RB1、NOTCH 1、FAT1和FBXW7;以及3個(gè)未在腫瘤中報(bào)道過(guò)的高頻突變基因PDE3A、PTPRM和CBLN2。

研究還發(fā)現(xiàn),細(xì)胞周期、p53、Notch 信號(hào)通路以及Wnt通路相關(guān)基因的體細(xì)胞改變積累。提示這些通路的改變可能是導(dǎo)致食道小細(xì)胞癌惡性進(jìn)展的關(guān)鍵。其中Wnt/β-catenin通路中DVL3和上游基因的擴(kuò)增、以及下游分子的表達(dá)上調(diào),證實(shí)了該通路在食道小細(xì)胞癌中顯著激活,是食道小細(xì)胞癌中重要的分子事件,今后需要進(jìn)一步研究這一現(xiàn)象背后的機(jī)制。

研究還發(fā)現(xiàn)了與染色質(zhì)重塑過(guò)程有關(guān)基因的顯著改變,并觀(guān)察到食道小細(xì)胞癌中與小細(xì)胞肺癌相似的體細(xì)胞基因組改變,如p53和RB1缺失以及Notch家族中的突變。其中,攜帶Notch家族基因突變的病人生存顯著差于未攜帶Notch家族基因突變的病人。

此外,通過(guò)和多種腫瘤的突變圖譜和拷貝數(shù)變異圖譜對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),食道小細(xì)胞癌與小細(xì)胞肺癌相比更接近食道鱗癌和頭頸部鱗癌,提示來(lái)源于食道的小細(xì)胞癌與來(lái)自肺的小細(xì)胞癌有不同的生物學(xué)背景。這些結(jié)果提示來(lái)自不同部位的小細(xì)胞癌具有異質(zhì)性,并不能被作為同一類(lèi)型疾病診治。

本研究揭示了食道小細(xì)胞癌的基因圖譜,發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵的基因組變異,并為更好地理解食道小細(xì)胞癌的發(fā)病機(jī)制和為這類(lèi)惡性疾病患者制定更好的治療策略提供了理論基礎(chǔ)。

原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41422-018-0039-1