本報(bào)訊 近日，記者從中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所獲悉，該所魚(yú)類(lèi)功能基因組學(xué)學(xué)科組負(fù)責(zé)的草魚(yú)全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國(guó)科學(xué)院國(guó)家基因研究中心和中山大學(xué)等機(jī)構(gòu)合作完成，相關(guān)研究成果于5月4日在線(xiàn)發(fā)表于《自然—遺傳學(xué)》雜志。

據(jù)該所研究員汪亞平介紹，該研究采用鳥(niǎo)槍法測(cè)序策略，分別對(duì)一尾雌性和一尾雄性草魚(yú)進(jìn)行了全基因組測(cè)序，成功獲得雌性（0.9GB）和雄性（1.07GB）草魚(yú)基因組組裝序列。其中，雌性草魚(yú)為人工減數(shù)分裂雌核發(fā)育個(gè)體，因其基因組雜合度顯著降低，獲得了高質(zhì)量的組裝序列；雄性草魚(yú)為野生個(gè)體，基因組組裝質(zhì)量明顯下降，但為雄性基因組特異片段的挖掘提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

草魚(yú)以草食性特征而得名，它們?nèi)绾螐乃葜屑橙I(yíng)養(yǎng)以支持其快速生長(zhǎng)一直是研究者關(guān)注的問(wèn)題。該研究結(jié)果表明，草魚(yú)基因組中并不存在纖維素降解酶基因。比較轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)，草魚(yú)在草食性轉(zhuǎn)化過(guò)程中，腸道中晝夜節(jié)律相關(guān)基因的表達(dá)模式發(fā)生了重設(shè)，肝臟中甲羥戊酸通路和類(lèi)固醇生物合成通路被激活。草魚(yú)可能通過(guò)持續(xù)高強(qiáng)度的食物攝入，獲取足夠的可利用營(yíng)養(yǎng)以維持其快速生長(zhǎng)。

草魚(yú)作為鯉科魚(yú)類(lèi)的代表性物種，其全基因組序列的解析，將為這種魚(yú)類(lèi)重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)基因的發(fā)掘和養(yǎng)殖品種的遺傳改良提供關(guān)鍵技術(shù)支撐，同時(shí)，也將為魚(yú)類(lèi)基因組演化、性別決定及分化機(jī)制等理論研究奠定重要基礎(chǔ)。