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中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院崔雋教授團(tuán)隊(duì)揭示選擇性自噬從表觀(guān)遺傳水平調(diào)控炎癥的新機(jī)制

稿件來(lái)源:生命科學(xué)學(xué)院 編輯:鄭龍飛、王冬梅 發(fā)布日期:2022-02-23 閱讀量:

中大新聞網(wǎng)訊(通訊員劉迪)細(xì)胞自噬(Autophagy)是真核生物細(xì)胞內(nèi)一種高度保守的蛋白質(zhì)降解和回收利用途徑,其不僅能夠形成自噬小體,廣泛地降解細(xì)胞內(nèi)有害的蛋白聚集物、老化的細(xì)胞器和侵染機(jī)體的病原微生物,還可以通過(guò)貨物受體介導(dǎo)的選擇性自噬,特異性識(shí)別和降解免疫細(xì)胞的關(guān)鍵調(diào)控蛋白,從細(xì)胞信號(hào)通路的水平上調(diào)節(jié)炎癥因子的產(chǎn)生和I型干擾素的釋放,并影響免疫細(xì)胞的分化、成熟和應(yīng)答。崔雋教授團(tuán)隊(duì)曾先后揭示了TRIM14分子通過(guò)招募去泛素酶USP14去除重要的細(xì)胞內(nèi)DNA受體cGAS和非經(jīng)典N(xiāo)F-kB通路中的核心轉(zhuǎn)錄因子p100/p52上的泛素識(shí)別信號(hào),降低貨物識(shí)別受體p62對(duì)cGAS及p100/p52的識(shí)別和選擇性自噬降解,促進(jìn)抗病毒免疫應(yīng)答和炎癥反應(yīng)的分子機(jī)制(Molecular Cell 2016,Advanced Science 2020)。然而,目前尚無(wú)研究揭示細(xì)胞自噬能否從表觀(guān)遺傳水平調(diào)控細(xì)胞的免疫應(yīng)答。

近日,中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院崔雋教授團(tuán)隊(duì)在PNAS雜志上發(fā)表了題為“TRIM14 inhibits OPTN-mediated autophagic degradation of KDM4D to epigenetically regulate inflammation”的研究成果,揭示了TRIM14復(fù)合物通過(guò)抑制貨物受體OPTN介導(dǎo)的針對(duì)組蛋白去甲基化酶KDM4D的選擇性自噬降解,降低促炎癥細(xì)胞因子Il12和Il23啟動(dòng)子附近組蛋白的H3K9三甲基化,從表觀(guān)遺傳水平上增強(qiáng)炎癥應(yīng)答的新機(jī)制。

該研究發(fā)現(xiàn)TRIM14可以負(fù)向調(diào)控細(xì)胞內(nèi)抑制基因轉(zhuǎn)錄的組蛋白H3K9三甲基化(H3K9me3)的水平,而對(duì)其他組蛋白修飾無(wú)明顯影響。進(jìn)一步的研究揭示TRIM14與組蛋白H3K9去甲基化酶KDM4D的蛋白水平呈正相關(guān)。TRIM14在炎癥刺激下可被誘導(dǎo)表達(dá),并與KDM4D相互作用,促進(jìn)去泛素化酶USP14和BRCC3結(jié)合到KDM4D上,去除KDM4D的K63泛素化修飾,從而抑制OPTN對(duì)KDM4D的信號(hào)識(shí)別,以及OPTN介導(dǎo)的KDM4D的選擇性自噬降解。通過(guò)ChIP-seq等分析手段,該研究發(fā)現(xiàn)TRIM14通過(guò)加強(qiáng)Il12和Il23啟動(dòng)子區(qū)域H3K9me3的去甲基化,在表觀(guān)遺傳層面上正向調(diào)控炎性因子IL-12和IL-23的表達(dá)。相關(guān)結(jié)果在小鼠的實(shí)驗(yàn)性自身免疫性腦脊髓炎(EAE)模型中得以進(jìn)一步驗(yàn)證:TRIM14的基因缺失對(duì)小鼠的神經(jīng)系統(tǒng)炎癥和損傷具有較強(qiáng)的保護(hù)作用。

TRIM14復(fù)合物通過(guò)抑制對(duì)KDM4D的選擇性自噬降解促進(jìn)炎癥反應(yīng)的工作模式圖

綜上所述,該工作揭示了TRIM14-USP14-BRCC3蛋白質(zhì)復(fù)合物在炎癥應(yīng)答過(guò)程中通過(guò)去除組蛋白去甲基化酶KDM4D的泛素化修飾,抑制貨物識(shí)別受體OPTN對(duì)KDM4D的選擇性自噬降解,通過(guò)影響組蛋白甲基化修飾,促進(jìn)特定炎癥因子的表達(dá),從表觀(guān)遺傳水平調(diào)控炎癥反應(yīng)的分子機(jī)制。

中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院崔雋教授為本文通訊作者,劉迪博士、趙芝瑤博士、佘元初博士為本文共同第一作者。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目資助。

論文鏈接:https://www.pnas.org/content/119/7/e2113454119

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