近日，中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院王銘輝教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合多家醫(yī)院及至本醫(yī)療，在《自然—通訊》刊發(fā)了一項(xiàng)針對(duì)亞洲癌癥人群基因組特征的研究成果。該成果從基因?qū)用鎸⒅袊?guó)人群與西方人群突變特征的異同進(jìn)行了系統(tǒng)分析和全面對(duì)比，全面闡述了東西方癌癥患者的不同臨床基因組特征，是截至目前最大規(guī)模的亞洲癌癥人群基因組全面分析。

研究共報(bào)告了超過(guò)1萬(wàn)例中國(guó)患者泛實(shí)體腫瘤體細(xì)胞突變情況，包含了25個(gè)癌種和100多個(gè)腫瘤亞型，首次發(fā)現(xiàn)64%的中國(guó)癌癥患者具有臨床上可用藥的潛在基因突變。這對(duì)選擇患者進(jìn)行分子靶向治療的臨床試驗(yàn)具有重要意義，也可以幫助制藥企業(yè)快速篩選藥靶，明確臨床適應(yīng)癥，制定新藥研發(fā)策略，加速新藥上市。

填補(bǔ)亞洲癌癥人群臨床基因組數(shù)據(jù)

癌癥的發(fā)病率和死亡率仍然是全球公共衛(wèi)生面臨的主要挑戰(zhàn)。國(guó)家癌癥中心的數(shù)據(jù)顯示，中國(guó)每年新發(fā)癌癥人群超過(guò)400萬(wàn)人，死亡人數(shù)超過(guò)200萬(wàn)人。近年來(lái)，隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展，癌癥正在向基因組學(xué)、精準(zhǔn)腫瘤學(xué)、個(gè)體化診療等方向快速發(fā)展。

癌癥的發(fā)生發(fā)展受基因、年齡、環(huán)境、習(xí)慣、地域等多因素影響。西方人群在這一領(lǐng)域的研究已取得了長(zhǎng)足進(jìn)步，發(fā)現(xiàn)了一系列在癌癥發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮驅(qū)動(dòng)作用的相關(guān)基因。

亞洲癌癥人群有著自己的“特色”，但遺憾的是，國(guó)內(nèi)一直缺乏大規(guī)模系統(tǒng)性的臨床基因組數(shù)據(jù)。

鑒于此，研究團(tuán)隊(duì)收集了超過(guò)萬(wàn)例亞洲癌癥患者的樣本，覆蓋100多種癌癥亞型，通過(guò)二代測(cè)序（NGS）技術(shù)對(duì)這些腫瘤樣本進(jìn)行全面測(cè)序和對(duì)比分析，并與已發(fā)表的最大的癌癥基因組研究——美國(guó)紀(jì)念斯隆·凱特琳癌癥中心（MSK）的隊(duì)列進(jìn)行了比較。

“我們從基因?qū)用鎸⒅袊?guó)人群與西方人群突變特征的異同進(jìn)行了系統(tǒng)分析和全面對(duì)比，全面闡述了東西方癌癥患者的不同基因組特征，研究填補(bǔ)了亞洲癌癥人群大規(guī)模癌癥基因組學(xué)對(duì)比研究的空白?！蓖蹉戄x表示，該研究為中國(guó)精準(zhǔn)治療的國(guó)際實(shí)時(shí)接軌提供了重要基礎(chǔ)證據(jù)。

為保證測(cè)序結(jié)果的一致性，論文作者之一、至本醫(yī)療生物信息部負(fù)責(zé)人陳惠表示，所有二代測(cè)序均由至本醫(yī)療負(fù)責(zé)，盡可能排除流程不一致造成的分析偏差，從而提供高質(zhì)量的數(shù)據(jù)分析基礎(chǔ)。

為接軌國(guó)際精準(zhǔn)治療提供證據(jù)

據(jù)了解，該研究共包含了31個(gè)民族的癌癥患者樣本，包含了25個(gè)癌種和100多個(gè)腫瘤亞型。主要腫瘤類(lèi)型是非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌、肝細(xì)胞癌、胃癌、食管癌、軟組織肉瘤、肝內(nèi)膽管癌、胰腺癌、肝外膽管癌和乳腺癌。

“我們對(duì)癌癥基因組與中國(guó)癌癥患者臨床特征進(jìn)行了系統(tǒng)的整合和大規(guī)模研究，主要集中在多個(gè)臨床特征（年齡、性別、腫瘤分期、吸煙史、治療和樣本類(lèi)型）的關(guān)聯(lián)上?！蓖蹉戄x說(shuō)，總的來(lái)講，臨床特征相關(guān)的基因組差異分布在結(jié)直腸癌和肺癌中。

比如，早期非小細(xì)胞肺癌的女性非吸煙者EGFR突變較多，而晚期非小細(xì)胞肺癌的男性吸煙者TP53、CDKN2A、PIK3CA和KRAS突變較多。

而東西方人群泛癌種的腫瘤組織體細(xì)胞基因組在各癌種中的發(fā)生率具有極大的相似性，只有少數(shù)幾個(gè)具有顯著差異。比如，在肺腺癌群體中，中國(guó)肺腺癌患者的EGFR和TP53突變頻率比西方人群高，而KEAP1突變頻率比西方患者低。

“這個(gè)結(jié)果說(shuō)明癌癥基因組特征無(wú)國(guó)界，種族之間差異很小，但在個(gè)別癌種上，中西方癌癥人群的基因突變有顯著差異。這為中國(guó)癌癥精準(zhǔn)治療與先進(jìn)的國(guó)際診療技術(shù)實(shí)時(shí)接軌提供了重要依據(jù)?！标惢菡f(shuō)。

期待更多患者得到個(gè)體化精準(zhǔn)診療

值得一提的是，該研究首次發(fā)現(xiàn)，64%的中國(guó)癌癥患者具有臨床上可用藥的基因突變。

按照中國(guó)每年400萬(wàn)新增癌癥人群計(jì)算，這意味著，每年有超過(guò)250萬(wàn)的中國(guó)癌癥患者可以通過(guò)基因檢測(cè)對(duì)癥用藥，選擇適合的靶向/免疫藥物，延長(zhǎng)生存期，獲得更高的生活質(zhì)量。

這還是第一次開(kāi)展大規(guī)模泛癌種腫瘤突變負(fù)荷（TMB）分析，揭示了TMB在泛癌種人群中的分布，表明中國(guó)肺癌患者有很高比例可以從免疫治療中獲益。

“該研究為癌癥醫(yī)學(xué)提供了高度可靠的數(shù)據(jù)集和資源。而精準(zhǔn)數(shù)據(jù)是個(gè)體化診療的基石，比如不同的性別、年齡結(jié)構(gòu)、生活習(xí)慣、發(fā)病部位、分子結(jié)構(gòu)。我們把這些信息串聯(lián)在一起，就可以找到最適合中國(guó)患者的個(gè)體化精準(zhǔn)診療方案，提高癌癥患者的五年生存率?！敝帘踞t(yī)療數(shù)據(jù)中心負(fù)責(zé)人王傲迪說(shuō)。

相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-022-31780-9

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